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中國科學院新疆生態(tài)與地理研究所（簡稱新疆生地所）于1998年7月7日由中國科學院新疆生物土壤沙漠研究所（1961年成立）和中國科學院新疆地理研究所（1965年成立）聯(lián)合重組成立,。
新疆生地所圍繞國家西部大開發(fā)戰(zhàn)略目標，在中國科學院創(chuàng)新基地建設(shè)的戰(zhàn)略思想指導下,，面向干旱區(qū)資源開發(fā)利用和生態(tài)安全與可持續(xù)發(fā)展戰(zhàn)略,，在“綠洲系統(tǒng)演化與綠洲生態(tài)農(nóng)業(yè)”、“脆弱與受損生態(tài)系統(tǒng)恢復(fù)與荒漠化防治”,、“資源開發(fā)利用與區(qū)域可持續(xù)發(fā)展”,、“特殊生物資源多樣性保護與利用”、“干旱區(qū)資源與環(huán)境監(jiān)測與決策”等方面開展前瞻性,、戰(zhàn)略性,、基礎(chǔ)性研究。在知識創(chuàng)新三期,，新疆生地所致力于將中亞區(qū)域科技合作和科學水平推向新的高度,努力建設(shè)在干旱區(qū)資源環(huán)境研究領(lǐng)域具有鮮明特色的國際知名研究所,。
新疆生地所現(xiàn)有5個研究室,、 9個野外臺站,。此外，還建有1個院級重點實驗室,、1個國家工程中心,、2個省級重點實驗室,，并附設(shè)有建筑面積4500m2的以干旱區(qū)資源與環(huán)境為特色的標本館。
截至2008年底,，新疆生地所共有在職職工303人,，流動人員539人，離退休人員172人,，進創(chuàng)新崗位124人,。在職人員中，共有科研人員242人,，科技支撐人員59人,，包括正高級專業(yè)技術(shù)人員25人、副高級專業(yè)技術(shù)人員77人,、中國科學院“百人計劃”入選者6人,、“國家杰出青年科學基金”獲得者1人；流動人員中,，共有客座研究員25人,、在學研究生294人（其中博士生111人、碩士生183人）,、在站博士后3人,。研究所設(shè)有自然地理學、人文地理學,、地圖學與地理信息系統(tǒng),、生態(tài)學、植物學5個博士培養(yǎng)點和7個碩士培養(yǎng)點,，并設(shè)有地理學,、生物學2個博士后流動站。
2008年,，新疆生地所共獲省部以上科技獎勵11項,。其中國家科技進步二等獎2項，分別為“塔里木河中下游綠洲農(nóng)業(yè)與生態(tài)綜合治理技術(shù)”（新疆生地所為第一完成單位）,、“塔里木沙漠公路防護林生態(tài)工程建設(shè)技術(shù)開發(fā)與應(yīng)用”（新疆生地所為第二完成單位）,；獲自治區(qū)科技進步獎9項，其中突出貢獻獎1項,、一等獎5項,、二等獎2項、三等獎1項,。宋郁東研究員被自治區(qū)人民政府授予科技進步獎突出貢獻專家獎,；“塔里木河中下游荒漠化防治與生態(tài)系統(tǒng)管理研究與示范”、“新疆塔里木河流域生態(tài)水文問題研究”、“新疆數(shù)字地貌的關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用研究”,、“北疆供水工程沙害防治試驗研究與應(yīng)用”,、“干旱區(qū)生態(tài)環(huán)境調(diào)控與管理”獲自治區(qū)科學技術(shù)進步獎一等獎。此外,，“塔里木沙漠公路生態(tài)防護林工程”在獲評“中國十大科技進展”后再獲“中國十大環(huán)境友好工程”和新疆工程設(shè)計一等獎,。
2008年，新疆生地所國際科技交流與合作總量為103批532人次,，共派遣出訪30批62人次,，接待來訪73批470人次，涉及到41個國家和地區(qū),，與中亞及周邊國家的交流量仍然保持在三分之一以上,；共舉辦10次國際研討會，包括國家層面的國際山地綜合發(fā)展中心高層戰(zhàn)略研討會,、第五屆中日科技戰(zhàn)略與政策研討會,、中巴邊境區(qū)域環(huán)境保護和可持續(xù)發(fā)展研討會、上海合作組織國立科研機構(gòu)科技合作研討會等學術(shù)會議,，其中上海合作組織國立科研機構(gòu)科技合作研討會就上海合作組織框架下區(qū)域科技合作的機制,、平臺建設(shè)、優(yōu)先領(lǐng)域和人才培養(yǎng)等內(nèi)容進行磋商討論,，最終形成了《宣言》,，確立了本地區(qū)科學院在上海合作組織框架下的合作機制，確定了優(yōu)先合作領(lǐng)域以及合作方式等問題,。
新疆生地所是新疆土壤肥料學會,、新疆地理學會、新疆植物學會,、新疆科學探險協(xié)會,、新疆自然資源學會的掛靠單位；承辦的科技期刊有《干旱區(qū)研究》,、《干旱區(qū)地理》,，以及同名在國內(nèi)發(fā)行的維文版刊物；擁有國家甲級水文水資源調(diào)查評價資質(zhì)證書,、國家乙級環(huán)評資格證書,、國家乙級測繪資質(zhì)證書、國家乙級旅游規(guī)劃設(shè)計資質(zhì)證書,、乙級土地定級估價證書,、農(nóng)林行業(yè)（營造林）乙級工程設(shè)計證書。
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