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中國(guó)科學(xué)院南海海洋研究所成立于1959年1月,，是我國(guó)規(guī)模最大的綜合性海洋研究機(jī)構(gòu)之一?，F(xiàn)有職工1200多人，研究員76人，博導(dǎo)69人,，國(guó)家杰出青年基金獲得者和青年“千人計(jì)劃”8名,，973首席科學(xué)家2人，中科院百人計(jì)劃26人,。擁有海洋科學(xué)一級(jí)博后流動(dòng)站和海洋科學(xué)一級(jí)博士學(xué)位授予點(diǎn),，在學(xué)研究生300人。
重點(diǎn)研究熱帶邊緣海海洋水圈－地圈－生物圈圈層結(jié)構(gòu)及其相互作用特征與演變規(guī)律,，探討其對(duì)資源形成和環(huán)境變化的控制和影響,，發(fā)展具有南海特色的熱帶海洋資源與環(huán)境過(guò)程理論體系和應(yīng)用技術(shù)。根據(jù)我國(guó)實(shí)施“科技興海”戰(zhàn)略和維護(hù)海洋權(quán)益的需求,，以南海區(qū)域海洋過(guò)程的理論創(chuàng)新為重點(diǎn),，推動(dòng)海洋應(yīng)用技術(shù)的重大突破，開(kāi)展海洋礦產(chǎn)資源勘查,、海洋生物資源利用,、海洋工程環(huán)境與軍事環(huán)境評(píng)價(jià)和預(yù)測(cè)等方面與經(jīng)濟(jì)建設(shè)和社會(huì)可持續(xù)發(fā)展相關(guān)的重大科學(xué)問(wèn)題研究和成果轉(zhuǎn)化，為發(fā)展我國(guó)海洋經(jīng)濟(jì)和維護(hù)海洋權(quán)益做出基礎(chǔ)性,、戰(zhàn)略性和前瞻性貢獻(xiàn),。
重點(diǎn)學(xué)科領(lǐng)域：熱帶海洋環(huán)境動(dòng)力與生態(tài)過(guò)程、邊緣海地質(zhì)演化與油氣資源,、熱帶海洋生物資源可持續(xù)利用和海洋環(huán)境觀測(cè)體系及其關(guān)鍵技術(shù),。
設(shè)有熱帶海洋環(huán)境國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中科院邊緣海地質(zhì)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（與廣州地化所共建）,、中科院海洋生物資源可持續(xù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,、廣東省海洋藥物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、廣東省應(yīng)用海洋生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,、中尺度海洋觀測(cè)（聯(lián)合）開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室和南海深海過(guò)程聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室,；有3個(gè)研究室和1個(gè)海洋環(huán)境工程中心。
擁有大亞灣海洋生物綜合實(shí)驗(yàn)站（國(guó)家野外試驗(yàn)站和中國(guó)生態(tài)系統(tǒng)研究網(wǎng)絡(luò)“CERN”站）,、海南熱帶海洋生物實(shí)驗(yàn)站（國(guó)家野外試驗(yàn)站和中國(guó)生態(tài)系統(tǒng)研究網(wǎng)絡(luò)“CERN”站）,、湛江海洋經(jīng)濟(jì)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)站、汕頭海洋植物實(shí)驗(yàn)站和西沙,、南沙深海海洋環(huán)境觀測(cè)站,；有“實(shí)驗(yàn)1”號(hào)、“實(shí)驗(yàn)2”號(hào)和“實(shí)驗(yàn)3”號(hào)三艘大型海洋科學(xué)考察船,；還擁有南海海洋生物標(biāo)本館和信息中心,。
近50年來(lái)，南海海洋所共取得科研成果663項(xiàng),，獲國(guó)家,、中科院、部委和省市級(jí)成果獎(jiǎng)236項(xiàng)；申請(qǐng)專利143項(xiàng),，獲授權(quán)專利72項(xiàng),；近年來(lái)發(fā)表SCI論文541篇。典型代表性成果有“南沙群島及其鄰近海區(qū)資源環(huán)境和權(quán)益綜合調(diào)查研究”和“熱帶海洋生物活性物質(zhì)的利用技術(shù)”等,。目前主持,、承擔(dān)973、863,、國(guó)家基金項(xiàng)目等200余項(xiàng),。與40多個(gè)國(guó)家和地區(qū)建立了學(xué)術(shù)聯(lián)系與合作，重點(diǎn)發(fā)展與歐,、美,、日、澳等海洋科學(xué)發(fā)達(dá)國(guó)家的合作與交流,，同時(shí)加強(qiáng)與南海周邊東盟國(guó)家的交流與合作,。每年承擔(dān)咨詢或院地合作項(xiàng)目150余項(xiàng)。
南海海洋所是全國(guó)海洋科研機(jī)構(gòu)首家獲得ISO9002質(zhì)量體系認(rèn)證的科研單位,，擁有國(guó)家“建設(shè)項(xiàng)目環(huán)境影響評(píng)價(jià)資格證書(shū)（甲級(jí)）”,、“海域使用可行性論證資格證書(shū)（甲級(jí)）”、“海洋專項(xiàng)工程勘察甲級(jí)證書(shū)”,、“計(jì)量認(rèn)證資質(zhì)證書(shū)”等,。是中國(guó)海洋學(xué)會(huì)海洋物理分會(huì)、廣東海洋湖沼學(xué)會(huì),、廣東海洋學(xué)會(huì)等的依托單位,。編輯出版《熱帶海洋學(xué)報(bào)》（核心期刊）。曾獲廣東省“文明單位”和廣州市“文明單位”,。
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